CellPhoneDB: Acesta este un instrument de analiză a comunicațiilor intercelulare bazat pe date transcriptomului unicelular. CellPhoneDB poate dezvălui interacțiunile celulă-celulă prin analiza interacțiunilor ligand-receptor. Instrumentul include o bază de date mare de perechi ligand-receptor cunoscute și poate calcula semnificația fiecărei interacțiuni între diferite tipuri de celule pe baza datelor dintr-o singură celulă.
NicheNet: Acesta este un instrument pentru analiza rețelelor de semnalizare intercelulară. NicheNet poate prezice gradul de activare a semnalizării de la celulă la celulă și impactul potențial al semnalizării asupra expresiei genei celulei țintă.
scTensor: Acesta este un instrument de analiză a datelor transcriptomului unicelular, bazat pe descompunerea tensorilor, care poate fi utilizat pentru a prezice comunicarea intercelulară. scTensor utilizează o metodă de descompunere a tensorii pe mai multe niveluri pentru a analiza interacțiunile dintre perechile ligand-receptor cunoscute în diferite tipuri de celule.
Acestea sunt doar câteva dintre numeroasele instrumente disponibile pentru analiza unei singure celule. Atunci când alegeți instrumentul potrivit, faceți compromisuri bazate pe designul experimental, tipul de date și obiectivele de analiză.